ssr_primer
Primer Details for TRINITY_DN12997_c3_g7_i1 |
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| (GGT)5gattattatatttatatcatccttccacggaaataatggagaaaatagggagataaggtca(AG)6: Primer 1 details |
|---|
| Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | GGTGGTGGTGGTGGTGATTA | CCCCTCCAACACACTGTCTC | Start: 155 |
| Tm | 59.597 | 59.965 | End: 267 |
| Size | 20 | 20 | 113 |
| Primer 2 details |
|---|
| Sequence | GGTGGTGGTGGTGGTGATTA | GCATGGCCCCAAATTTAGCC | Start: 155 |
| Tm | 59.597 | 60.179 | End: 305 |
| Size | 20 | 20 | 151 |
| Primer 3 details |
|---|
| Sequence | AACAAAGGGTGGTGGTGGTG | CCCCTCCAACACACTGTCTC | Start: 148 |
| Tm | 60.686 | 59.965 | End: 267 |
| Size | 20 | 20 | 120 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | CAACAAAGGGTGGTGGTGGT | CCCCTCCAACACACTGTCTC | Start: 147 |
| Tm | 60.686 | 59.965 | End: 267 |
| Size | 20 | 20 | 121 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | GGTGGTGGTGGTGGTGATTA | ATTCCCCCTCCAACACACTG | Start: 155 |
| Tm | 59.597 | 59.594 | End: 271 |
| Size | 20 | 20 | 117 |
(AT)11: Primer 1 details | | Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | GGTGGTGGTGGTGGTGATTA | CCCCTCCAACACACTGTCTC | Start: 155 |
| Tm | 59.597 | 59.965 | End: 267 |
| Size | 20 | 20 | 113 |
| Primer 2 details |
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| Sequence | GGTGGTGGTGGTGGTGATTA | GCATGGCCCCAAATTTAGCC | Start: 155 |
| Tm | 59.597 | 60.179 | End: 305 |
| Size | 20 | 20 | 151 |
| Primer 3 details |
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| Sequence | AACAAAGGGTGGTGGTGGTG | CCCCTCCAACACACTGTCTC | Start: 148 |
| Tm | 60.686 | 59.965 | End: 267 |
| Size | 20 | 20 | 120 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | CAACAAAGGGTGGTGGTGGT | CCCCTCCAACACACTGTCTC | Start: 147 |
| Tm | 60.686 | 59.965 | End: 267 |
| Size | 20 | 20 | 121 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | GGTGGTGGTGGTGGTGATTA | ATTCCCCCTCCAACACACTG | Start: 155 |
| Tm | 59.597 | 59.594 | End: 271 |
| Size | 20 | 20 | 117 |
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