ssr_primer
Primer Details for TRINITY_DN12510_c4_g2_i2 |
|---|
| (A)10: Primer 1 details |
|---|
| Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 157 |
| Primer 2 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 170 |
| Primer 3 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 156 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 169 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CTCTCCCCTCTCTCACAGGT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.665 | End: 3215 |
| Size | 20 | 20 | 211 |
(A)14: Primer 1 details | | Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 157 |
| Primer 2 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 170 |
| Primer 3 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 156 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 169 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CTCTCCCCTCTCTCACAGGT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.665 | End: 3215 |
| Size | 20 | 20 | 211 |
(AT)6tttcctgtttttttcttc(T)10: Primer 1 details | | Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 157 |
| Primer 2 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 170 |
| Primer 3 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 156 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 169 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CTCTCCCCTCTCTCACAGGT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.665 | End: 3215 |
| Size | 20 | 20 | 211 |
(GA)6: Primer 1 details | | Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 157 |
| Primer 2 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 170 |
| Primer 3 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | CATGCCCGAACTCCTTCCTT | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 60.035 | End: 3161 |
| Size | 20 | 20 | 156 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | TAAACGGCCGCCATGGTTAA | TCTTCCTTTTCCCCATGCCC | Start: 3006 |
| Tm | 60.322 | 59.959 | End: 3174 |
| Size | 20 | 20 | 169 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | ATAAACGGCCGCCATGGTTA | CTCTCCCCTCTCTCACAGGT | Start: 3005 |
| Tm | 60.107 | 59.665 | End: 3215 |
| Size | 20 | 20 | 211 |
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